基因编辑
CIE A-Level 生物学· 40 分钟阅读
1. CRISPR-Cas9的作用机制★★★☆☆⏱ 15 min
CRISPR-Cas9
细菌和古菌中天然存在的适应性免疫系统,被改造为可用于真核生物基因组的精准基因编辑工具
例:
用于编辑人类细胞中的CCR5基因,使其获得HIV抗性
CRISPR(成簇规律间隔短回文重复序列)是细菌基因组中的短重复DNA序列,来源于既往病毒感染留下的DNA片段。当同种病毒再次感染细菌时,CRISPR系统转录出向导RNA(gRNA),识别匹配的病毒DNA序列。
Cas9酶是一种DNA核酸酶,可在与gRNA互补的目标序列处切割DNA。目标序列旁必须存在一段称为PAM(原间隔序列邻近基序)的短序列,Cas9才能结合并切割DNA。
描述CRISPR-Cas9如何靶向人类基因组中特定的20碱基对序列,产生双链断裂。
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设计合成向导RNA(gRNA),使其与位于PAM序列旁的20碱基对目标序列互补(最常用的Cas9识别的PAM序列为5'-NGG-3')。
- 2
gRNA与Cas9酶结合,形成有活性的Cas9-gRNA复合物。
- 3
复合物在细胞核中扩散,与互补的目标DNA序列碱基配对。
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Cas9确认PAM序列存在后,在PAM序列上游3个碱基对处产生双链断裂。
2. DNA修复途径与编辑结果★★★☆☆⏱ 10 min
Cas9在目标位点产生双链断裂后,细胞会通过两种主要途径之一修复断裂,两种途径产生的编辑结果差异很大。
非同源末端连接 (NHEJ)
一种易错的DNA修复途径,无需修复模板即可将两个断裂的DNA末端连接在一起
例:
最常引入小的插入或缺失(indels),导致基因的读码框移位,使其功能失活
第二种途径是同源定向修复(HDR),仅发生在细胞周期的S期和G2期,此时存在同源模板。如果提供了带有目标编辑的合成供体DNA模板,HDR会利用它进行精准编辑。
研究人员想要向目标基因中插入特定的单核苷酸突变,他们应该使用哪种修复途径?需要哪些步骤?
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研究人员使用HDR,因为NHEJ易错,会产生随机突变,无法获得特定的目标编辑。
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除切割目标位点的Cas9和gRNA外,研究人员还加入了合成的供体DNA模板。模板带有目标单核苷酸突变,两侧是与断裂两端区域同源的序列。
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细胞内源性的HDR机制利用同源供体模板修复断裂,将目标突变整合到基因组中。
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随后对编辑后的细胞进行筛选和验证,确认存在正确的突变。
3. 基因编辑的应用★★☆☆☆⏱ 15 min
基因编辑目前在农业、医学和基础生物学研究中已有广泛应用,还有更大的应用潜力。
农业:编辑作物基因组,提高产量、抗旱性、抗虫性或营养成分(例如不易褐变的蘑菇、高产油菜)。
医学:编辑人类体细胞治疗遗传病(例如编辑造血干细胞治疗镰状细胞贫血,编辑T细胞用于癌症免疫治疗)。
研究:构建基因敲除细胞系或动物模型,研究未知基因的功能。
概述如何利用基因编辑培育无角牛,避免痛苦的去角过程。
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一些牛品种天然携带控制无角性状的显性等位基因。
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设计向导RNA,靶向有角牛受精卵中的无角基因座。
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Cas9切割目标基因座,随后向受精卵中引入含有天然无角等位基因的供体DNA模板。
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HDR将无角等位基因整合到基因组中,获得的编辑牛出生即无角,无需去角。
4. 基因编辑 vs 传统转基因技术★★★★☆⏱ 10 min
CIE考官经常要求考生区分现代基因编辑和较早的传统转基因(GM)技术,因此记住关键区别非常重要。
两种方法的关键区别如下:
传统转基因技术
将完整的功能性外源基因(例如来自苏云金芽孢杆菌的Bt毒素基因)随机插入宿主基因组的某个位置
+ 优点: 技术成熟,对大多数生物而言易于操作
− 缺点: 随机插入可能破坏内源基因,会永久插入外源DNA
基因编辑
对宿主自身现有的内源基因进行定向精准修改;大多数编辑不涉及外源DNA插入
+ 优点: 插入诱变风险低,基因组改变可预测
− 缺点: 技术难度更高,仍可能出现罕见的脱靶切割
5. 常见陷阱
错误做法:
认为Cas9切割的是向导RNA,而非目标基因组DNA
原因:
混淆了gRNA的向导作用,错误将其当作切割底物
正确做法:
Cas9是一种核酸酶,可在与向导RNA互补的序列处切割目标基因组DNA
错误做法:
声称所有基因编辑都会向基因组中插入外源DNA
原因:
将基因编辑与传统转基因技术混淆,传统转基因技术总会添加外源DNA
正确做法:
许多基因编辑是通过NHEJ实现的小片段敲除,不涉及任何外源DNA插入
错误做法:
混淆NHEJ和HDR,认为NHEJ是精准修复途径
原因:
常见的记忆错误,会让你丢掉考试中的送分题
正确做法:
同源定向修复(HDR)是利用供体模板的精准途径;NHEJ易错,会产生随机突变
错误做法:
忘记CRISPR原本是细菌的免疫系统
原因:
CIE经常考查CRISPR系统的来源,这个分数经常被漏掉
正确做法:
CRISPR-Cas9是天然存在于细菌和古菌中的适应性免疫系统
6. 速查表
组分/过程 | 作用 | 主要结果 |
|---|---|---|
向导RNA | 引导Cas9到达目标序列 | 确定正确切割位点 |
Cas9 | 核酸酶 | 产生双链断裂 |
PAM序列 | Cas9结合必需的位点 | 确认目标正确 |
NHEJ修复 | 无需模板修复断裂 | 随机插入缺失,基因敲除 |
HDR修复 | 利用供体模板修复断裂 | 精准定向编辑 |
传统转基因 | 随机插入基因 | 增加新功能,存在插入风险 |
基因编辑 | 靶向现有DNA | 精准改变,插入风险低 |
7. 常见问题
基因编辑和传统转基因技术的区别是什么?
传统转基因技术将外源基因插入基因组的随机位置,而基因编辑对生物自身现有DNA进行定向精准修改,通常不会随机插入外源DNA。
CRISPR仅用于敲除基因吗?
不是。CRISPR可通过NHEJ敲除基因,也可根据所用的Cas9变体和修复途径,用于精准基因敲入、单碱基编辑和基因调控。
真题中的出现
AI 根据考纲规律估算的考点位置,请对照官方真题核实准确性。仅作复习重点参考。
- 2022 · 22
描述CRISPR-Cas9的作用机制
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比较基因编辑与传统转基因技术
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概述基因编辑的应用
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基因编辑是CIE A-Level生物学遗传技术单元的核心考点,经常在试卷2的拓展回答题中考查。它与更广泛的概念相关,包括遗传变异、生物技术伦理、支持全球粮食安全的农业改良。理解基因编辑的工作原理也是评估现代遗传技术利弊的关键,这是考试中常见的主题。掌握这些知识后,你就能回答不同基因工程技术之间的比较题,并评估不同场景下支持和反对使用基因编辑的伦理论点。
